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Gene Runnerv6.5.51最新版

基因序列分析软件

  • 软件大小:19.4MB
  • 软件语言:英文
  • 软件类型:国产软件
  • 软件授权:免费版
  • 更新时间:2019-10-06
  • 软件类别:行业相关
  • 软件官网:
  • 应用平台:xp/win7/win8/win10
软件星级

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Gene Runner是一款专业的基因序列分析软件,它主要为遗传学家和生物学家提供了可靠的工具,可以帮助他们进行基因分析提供方便。它为生物学家提供了多种分析方式,确保分析结果百分百准确,为生物研究做出巨大的贡献。目前该软件不支持中文,不过肯定难不倒你们,欢迎大家下载使用。

Gene Runner安装教程

1、首先在100down站下载Gene Runner v6.5.51安装包,双击打开

Gene Runner

2、选择安装位置

3、正在安装,请稍等

4、完成安装,打开软件

5、进入软件主界面

软件介绍

生物基因分析Gene Runner是一个专业的应用,为遗传学家和生物学家提供了可靠的工具,可以帮助他们进行基因分析提供方便。

该应用程序需要包含遗传信息序列格式的文件,然后可以使用“ORF”(开放阅读框)按钮,使用户能够设置首选核苷酸或氨基酸大小,以及选择“转换表”分析一起工作。开的ORF项目后,用户可进行各种注释为每个条目。

在'序列和杂交分析“功能允许用户显示所选择的DNA部分的引物的特性,或放弃某些类型的引物。

基因转轮保存在表格上氨基酸的信息和该数据也可与“蛋白质分析”函数中,“抑制”和“转换表'使用。这是必需的作为基因转轮将发送一个错误消息,如果使用的氨基酸未在所述表格中定义的。此外,关于这些元素的所有信息是可编辑的,这样用户就可以充分地调整自己的价值观。

软件功能

1、查找:在此框中输入查询序列。查询序列可能包含IUPAC通配符。碱基或氨基酸总数显示在查询框右侧的框中。也可以使用shift+ins或ctrl+v键从剪贴板粘贴查询序列(打开对话框窗口时,不能使用菜单中的编辑粘贴)。这个发现只接受一个字母的氨基酸代码。在一个或三个字母的代码显示中可以找到合适的氨基酸。如果find以前用于当前序列,请键入以前搜索的文本。每个序列都有自己的查找内存。

2、主题:当搜索设置为蛋白质时,单击向下箭头显示Prosite主题的下拉列表。有关prosite及其序列约定的说明,请参见下文。当设置为核酸时,将显示核酸基序列表。选择所需的主题。然后,Motif会自动输入find:框中。此特征允许识别TATA盒、AP1结合位点、N-糖基化位点等。

3、类型:确定执行的搜索类型:标准、主题或不匹配。

4、标准是对在“查找:”框中输入的查询序列的正常搜索。用于简单搜索或核酸搜索,所有碱基/氨基酸必须完全匹配。

5、motif是在motif框中搜索查询序列,或使用prosite约定在find:框中输入的序列,请参见下文。蛋白质和核酸的基序可以以相同的惯例输入。注意:此搜索比标准搜索慢。

6、mismatch<=将搜索设置为不匹配,并设置查询序列中不匹配碱基/氨基酸的最大数目。默认设置为查询序列长度/5。stk>=设置不匹配搜索中相邻碱基/氨基酸(一个堆栈)的最小数目。默认设置为查询序列长度/2。与不匹配参数一起使用,以微调搜索。例如,如果将不匹配设置为4,并且在18个低聚物上将STK设置为6,则所找到的序列必须至少包含6个连续的完全匹配碱基,并且总共不超过4个不匹配碱基。当“全部显示”命令处于活动状态时,所有不匹配的序列都将突出显示。用于检查杂交探针、测序引物等,以确定假启动部位。

7、find仅搜索活动序列中第一个出现的查询序列。光标位于查询序列的5'碱基(或蛋白质中的氨基末端),查询序列突出显示。搜索从光标位置开始到序列结束。即使查询序列扩展到循环序列开始和结束之间的“joint”上,也会找到该查询序列。状态栏显示找到序列的第一个和最后一个碱基或氨基酸的位置。要再次搜索查询序列的另一个匹配项,请在“编辑”菜单下选择“再次查找”。快捷键是F6。“再次查找”按钮位于工具栏中“查找”按钮旁边。

软件特点

1、格式化多行复制

2、EZ Clone - 解决复杂克隆问题的简单方法

3、查看ABI文件 - 单个序列或多个ABI文件的对齐

4、动态搜索 - 在编辑序列时自动搜索和突出显示

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